目前于深圳执业的两岸会计师张聪德说，虽然目前并无直接资料可证实，到底有多少台商因误触海关法令遭到中共拘捕，但实际上，在今年下半年广东海关一连串的查税行动中，的确已有不少台商遭到罚款，而广东台商会误触的中国大陆法令中，又以海关税务法令最严重，这甚至已成为影响台商人身安全与永续经营的一大因素。
张聪德指出，中国大陆的通关保税制度在运作过程中，的确仍存在着一些缺失，导致台商企业在运转时，会因为“转厂”（指台商加工厂将已经初步加工后的保税产品，交由下游工厂继续加工的程序）手续的办理，与送货交易的事实，同时存在着时间上的差异，大多数的情况下是“先送货、后转厂”再办理核销，这与中国大陆海关规定“先转厂、后送货”，产生了程度上的落差。
又或者，台商也会因为买卖双方在办理转厂手续时，双方的海关对于同样商品的认定名称、商品编码、单位重量及商品单价会有不同，导致无法办理转厂的情况；采用内购的原物料进行合同的核销，会因为取得合法发票的困难度相当的高，因此无法办理核销。
而基于以上种种原因，就会造成台商生产合同的余料数量与仓库的实际数量之间，存在着或多或少的差异，而在面临海关查厂时，若对于差异数量无法以有效、合理的原因来解释，就会被认定有走私的嫌疑，造成台商人身安全的伤害。
另一方面，除税务问题外，台商实际还要面对中国大陆地方政府的乱摊派收费与公关成本。据广东一家台湾上市公司台干保守估计，目前台商所要应付地方的税费索求，以及隐性的公关成本，约占中共中央规定纳税额的一倍左右，而台商企业的发展，从水电到厂区治安，事实上都需要地方官员的配合，所以只有任由地方官员予取予求。
而在开拓大陆市场方面，所有外销型制造业台商在大陆设厂，主要目的之一，当然也着眼于发展中的大陆内销市场，尤其在面对国际产品滞销时，若能将产品转内销，将帮助许多台商渡过难关，但台商在将产品转内销时，却要面对综合约百分之四十的高税率，丧失了在大陆市场的竞争力。
此外，大陆虽然已经加入世贸组织，但金融外汇管制仍然没有全部解除限制，台资银行目前在大陆除“华一银行”外，都还只是不能发展任何业务的办事处，中小企业台商运用大陆本土资金发展，几乎不大可能。
同时，中共对于投资项目有许多限制，甚至禁止投资，例如行动电话的制造，管制就相当严格，不利于台商在国际上的竞争。而大陆投资服务与零售业项目的限制，尤其东南沿海严格控制外商进入部分服务业，如连锁经营，一般只能以特许方式申请，或只能与“中方”合资经营，不能独资，导致许多台商只能用人头等方式违法经营，也造成了台商经营的法律风险。
所以，对于只因为部分媒体宣传，例如上海投资热，就想到大陆投资当老板的台湾业者而言，实在应该好好评估与思考到大陆经营的法律风险，否则不仅资金可能血本无归，甚至还可能面对牢狱之灾，而这些大陆台商经营的真相，更是广大台湾民众都需思考的课题。
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