泉州色目人對元朝政府壓迫的反抗
元朝末年色目人的反叛——波斯戍兵之亂
亦思巴奚兵亂是元朝末年的1357年至1366年間在福建發生的一場長達近十年的以波斯色目人軍隊「亦思巴奚軍」為主的軍閥混戰，由於「亦思巴奚」是泉州波斯人的武裝，因此此事件也被稱為「波斯戍兵之亂」。在兵亂期間，亦思巴奚軍割據泉州並插手福建政治，一度北上佔領了福州，還參與了興化的鄉族內戰，引發了福建沿海的多個派別參加的大規模混戰，後來又與元朝的福建行省政府直接對抗，最後被元朝將領陳友定平定。這場兵亂波及泉州、福州、興化等地，造成大量平民的死亡，兵亂期間和過後還發生了宗教和民族仇殺，它重創了泉州、興化一帶的社會經濟，更導致當時世界最大港口泉州盛極一時的海外貿易大幅衰落，泉州的伊斯蘭教也漸漸衰退。
亦思巴奚兵亂長達近十年之久，對泉州、興化一帶的社會經濟產生了極大的破壞，人民飽受戰亂，死傷無數，尤其在那兀納統治泉州期間大肆搜刮財產和民女，屠戮泉州百姓，對泉州社會造成重創。興化路三縣在戰爭中有超過2萬民眾死亡，4萬多座房屋被焚燬。因為戰爭和兵亂期間教派暴力對抗的關係，泉州很多清真寺都被毀壞，現今僅存通淮街的清淨寺這一座古清真寺，泉州的伊斯蘭教因此衰落。連基督教（天主教）也受到連累，主教哲姆斯離開泉州，泉州基督教因而中斷了約200年。亦思巴奚兵亂帶來了嚴重的族群間的仇視和對立，漢人對色目人的仇恨在亦思巴奚兵亂被平定後開始發泄出來，陳宗海部隊佔領泉州後進行了3日的大屠殺，許多色目人遇害，甚至有漢人因為長著高鼻樑或捲髮而被誤殺的，也有掘墓鞭屍的行為出現，蒲壽庚家族墳墓被掘開，其家族成員更是多有受酷刑之後被殺的。由於戰亂和仇殺，外國商人幾乎不敢赴泉州進行交易，番舶不敢進港，大量番商外逃，外僑社區解體，泉州的海外貿易和商業遭受近乎毀滅性的打擊，經濟一落千丈，泉州港開始走向沒落。
對於亦思巴奚戰亂，歷代各方的學者大多都持否定的態度，認為它造成了生靈塗炭、民族仇殺、人口減少、經濟衰退、泉州港盛極而衰的嚴重負面影響。但對其起因和性質，學界則有不同的看法。代表明代官方學者觀點的《元史》把亦思巴奚兵亂認為是一場反對元朝政府的叛亂事件。而現代一些研究者認為亦思巴奚戰亂乃是元末福建政府和地方豪強之間爭權角力引發的，是由福建行省平章政事（稱為「省」）和廉訪使（稱為「憲司」）之間爭奪權力的「省憲構兵」所引發，繼而進一步引起地方豪強的爭戰。也有人將亦思巴奚戰亂歸因於泉州遜尼派穆斯林和什葉派穆斯林之間的教派衝突，而戰亂前後都伴隨著兩大教派間的衝突乃至殺戮。還有一種說法是亦思巴奚軍意在反叛元朝，是波斯人企圖以泉州為基地建立亦思法杭國的事變，這種說法在史學界也頗具影響力。另外一種說法是亦思巴奚兵亂是元朝宮廷鬥爭在福建的反映，是元順帝朝廷中以闊廓帖木兒為首的老帥派與以太子識裡答臘為首的太子派之間為爭奪元朝最大港口泉州的巨額商業利益而引發的派系鬥爭、而亦思巴奚軍諸首領僅是宮廷鬥爭的工具甚至犧牲品。也有人將此戰亂歸結為泉州色目人對元朝政府壓迫的反抗。