２０世紀９０年代以來，中國的鼠疫疫情呈現上升趨勢，新疫源縣不斷出現，部分鼠疫靜息疫源地重新活躍，動物鼠疫流行範圍逐漸擴大；鼠疫疫情向城市、人口密集區逼近；隨著交通的日益發達，增加了鼠疫遠距離傳播的機會。
據新華網報導，「十五」期間，雲南、貴州、廣西、西藏、青海、甘肅和內蒙古７省、自治區，４３縣次發生人間鼠疫２０６例，死亡２４例；雲南、廣西、貴州、西藏、青海、甘肅、新疆、四川、內蒙古、寧夏、河北、陝西、遼寧、吉林１４省、自治區２７８縣次發生動物鼠疫疫情；新增１３個鼠疫疫源縣。
目前，中國鼠疫疫源地分布於１９個省、自治區，２８６個縣（市、旗），疫源地面積１１５萬平方公里。
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