據報導，賴昌星及其遠華集團大肆從事走私活動，早在北京當局的掌握中。距遠華案發前一年的第九屆全國人大召開時，一福建省高級官員向剛當選總理的朱鎔基介紹賴昌星及其遠華集團對福建及國家的貢獻如何之大，並請朱鎔基接見賴昌星。朱鎔基當即指賴昌星及遠華集團存在嚴重的走私行為，「如果他願意補交數十億的稅款，就可以考慮接見。」此後相當一段時期，中共並未對此走私立案，就是因為其中涉及中共高層的背景。
福建省前省委書記、目前任中共政治局委員、北京市委書記的賈慶林，中共軍方及公安部的相當一部分高級官員都是其政治後臺，而賈是江澤民一手提拔的親信紅人，所以不能輕易動得。北京政界人士透露，遠華案之所以案發其實是源於中共高層的政治鬥爭。去春，朱鎔基訪美時，為加快中國市場經濟的建設步伐，在與美國簽署經貿協定中作了相當讓步，讓步程度甚至超出美方預期甚多，引起國內各產業部門的不滿，朱甚至被人罵為「李鴻章第二」，以李鵬為首的反對派乘機向朱鎔基發難，江澤民也因朱張揚的個性和超高民意支持而感到不滿和受威脅，因而朱訪美回國後的處境非常被動。
更嚴重的是，不久後發生中國駐南聯使館被炸事件，無異讓朱的處境雪上加霜，關鍵時期朱被迫提出辭職，但為防止因深得民意的朱辭職可能引爆內亂，江澤民斷然拒絕朱的辭職，但準備在事件平息後以自己的親信賈慶林頂替朱鎔基任總理。然而儘管朱鎔基一再表明自己不是政治家不會耍權術，但也決非是個省油的燈。他抓住賈慶林的遠華背景，聯合喬派（喬石）人物尉建行開始全面調查遠華走私案，從而徹底擊碎江澤民想讓賈慶林頂替朱的計畫。
為了避免賈慶林落馬，有損自身形象和地位，江澤民一度帶著賈慶林在國內四處視察，讓賈頻頻露面，為其「闢謠」；江此一舉措，引起朱的不滿，江則藉接班之需，讓胡錦濤行使部分總理權，以架空朱鎔基。迄今，遠華案處理已近兩年，被審和即將被審的中共官員共兩百餘人。北京消息人士說，只要朱鎔基不被撤職或不出其他意外，朱一定會在其任內以審賴昌星為突破口，進一步深究中共高層的腐敗，兌現其剛出任總理時對民眾的承諾。
然而，如果朱真採此舉措，則必然引起中共高層的激烈衝突。因為江不想在中共十六大上全退，也就不會容許有損自己形象的事情發生，朱如繼續深究，江必失信於天下，也就為第四代中共領導集體阻止江繼續把持軍權提供了理由。北京觀察家認為，遠華走私案最終的處理結果會是多殺幾個位重權虛的高官，賴昌星也是必死無疑，一切都以不損害中共及江澤民地位為目標。（工商時報2000/12/06）
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